竹山 春子 Haruko Takeyama

所 属

早稲田大学 先進理工学部 生命医科学科 教授

研究分野

マリンバイオテクノロジー、遺伝子工学、分子生物学、微生物工学、環境ゲノム工学、バイオマスエネルギー、バイオセンサー、バイオ計測

研究内容

海洋を含め私たちの環境に生息している微生物の多くは分離・培養をすることが難しい難培養微生物です。そこで、未知・難培養微生物を中心として様々な環境微生物のゲノムを一括して収集、解析し、 有用遺伝子のスクリーニングや新規有用組換え生物の作出等の研究を行っています。また、これらの微生物と取り巻く環境との関係を遺伝子情報を基に紐解く研究も行っています。 さらに、これら微生物のより詳細な解析をするために、細胞1つからゲノムを取り出し解析することで、どのような機能を持つ微生物であるかを明らかにしたり、 より確実に細胞1つをハンドリングするためのマイクロデバイス開発も行っています。これらの技術は、微生物だけでなく私たちを含めた動物細胞の解析にも展開しています。

最近の研究成果

1. Kogawa M, Hosokawa M, Nishikawa Y, Mori K, Takeyama H.
Obtaining high-quality draft genomes from uncultured microbes by cleaning and co-assembly of single-cell amplified genomes.
Sci Rep. 2018 Feb 1. 8(1):2059. doi: 10.1038/s41598-018-20384-3.

2. Hosokawa M, Nishikawa Y, Kogawa M, Takeyama H.
Massively parallel whole genome amplification for single-cell sequencing using droplet microfluidics.
Sci Rep. 2017 Jul 12. 7(1):5199. doi: 10.1038/s41598-017-05436-4.

3. Yoda T, Hosokawa M, Takahashi K, Sakanashi C, Takeyama H, Kambara H.
Site-specific gene expression analysis using an automated tissue micro-dissection punching system.
Sci Rep. 2017 Jun 28. 7(1):4325. doi: 10.1038/s41598-017-04616-6.

4. Yoda T, Tanabe M, Tsuji T, Yoda T, Ishino S, Shirai T, Ishino Y, Takeyama H, Nishida H.
Exonuclease processivity of archaeal replicative DNA polymerase in association with PCNA is expedited by mismatches in DNA.
Sci Rep. 2017 Mar 16. 7:44582. doi: 10.1038/srep44582.

5. Maruyama T, Mori T, Yamagishi K, Takeyama H.
SAG-QC: quality control of single amplified genome information by subtracting non-target sequences based on sequence compositions.
BMC Bioinformatics. 2017 Mar 4. 18(1):152. doi: 10.1186/s12859-017-1572-5.

研究室のHPアドレス

http://www.f.waseda.jp/haruko-takeyama/index.html