細川 正人 Masahito Hosokawa

所 属

早稲田大学 生命医科学専攻

研究分野

生物工学、マイクロ流体デバイス、ゲノム解析

研究内容

ゲノムは細胞の個性を知る基礎情報であり、微生物の多様性や疾患につながる異常発生の理解に不可欠です。しかし、細胞に含まれるゲノムは微量であるため、高精度にその配列を読み取るには大量の細胞が必要でした。このため、細胞個々に蓄積した変異を解析することや培養できない微生物のゲノム配列解析が非常に困難でした。そこで、我々はマイクロ流体デバイスや特殊微細加工装置を用いて、細胞1つや微量な組織片から微量な生体分子計測を可能とする技術開発を行い、病理サンプルや環境微生物の解析に応用しています。

最近の研究成果

1. Kogawa M, Hosokawa M, Nishikawa Y, Mori K, Takeyama H, "Obtaining high-quality draft genomes from uncultured microbes by cleaning and co-assembly of single-cell amplified genomes.", Scientific reports 8(1) 2059 2018

2. Kashima Y, Suzuki A, Liu Y, Hosokawa M, Matsunaga H, Shirai M, Arikawa K, Sugano S, Kohno T, Takeyama H, Tsuchihara K, Suzuki Y, "Combinatory use of distinct single-cell RNA-seq analytical platforms reveals the heterogeneous transcriptome response.", Scientific reports 8(1) 3482 2018

3. Hosokawa M, Nishikawa Y, Kogawa M, Takeyama H, "Massively parallel whole genome amplification for single-cell sequencing using droplet microfluidics.", Scientific reports 7(1) 5199 2017

4. Yoda T, Hosokawa M, Takahashi K, Sakanashi C, Takeyama H, Kambara H, "Site-specific gene expression analysis using an automated tissue micro-dissection punching system.", Scientific reports 7(1) 4325 2017

5. Nishikawa Y, Hosokawa M, Maruyama T, Yamagishi K, Mori T, Takeyama H., "Monodisperse picoliter droplets for low-bias and contamination-free reactions in single-cell whole genome amplification", PLoS ONE 10(9) 2015

研究室のHPアドレス