所 属

早稲田大学　理工学術院総合研究所　招聘研究員

研究分野

ゲノム・メタゲノム科学、バイオインフォマティクス

研究内容

人体には約1,000菌種、数百兆個の常在菌が生息し、ヒトの健康と病気に大きく関係しています。これら常在菌が形成する細菌叢（集団） の全体像と宿主細胞との相互作用を介した常在菌叢の生理作用を、次世代シークエンサーを用いたメタゲノム技術と情報学・統計学を駆使 したゲノム科学的アプローチによって解明します。

最近の研究成果

1. Chiou TY, Suda W, Oshima K, Hattori M, Matsuzaki C, Yamamoto K, Takahashi T.
Lactobacillus kosoi sp. nov., a fructophilic species isolated from koso, a Japanese sugar-vegetable fermented beverage.
Antonie Van Leeuwenhoek (2018) in press. doi:10.1007/s10482-018-1019-7.

2. Koizumi T, Hattori M, Nara K.
Ectomycorrhizal fungal communities in alpine relict forests of Pinus pumila on Mt. Norikura, Japan.
Mycorrhiza (2018) in press. doi:10.1007/s00572-017-0817-5.

3.Costea PI, Hildebrand F, Manimozhiyan A, Backhed F, Blaser MJ, Bushman FD, de Vos WM, Ehrlich SD, Fraser CM, Hattori M, Huttenhower C, Jeffery IB, Knights D, Lewis JD, Ley RE, Ochman H, O'Toole PW, Quince C, Relman DA, Shanahan F, Sunagawa S, Wang J, Weinstock GM, Wu GD, Zeller G, Zhao L, Raes J, Knight R, Bork P.
Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition.
Nat. Microbiol. (2018) 3:8-16. doi:10.1038/s41564-017-0072-8.

4. Naganuma M, Sugimoto S, Mitsuyama K, Kobayashi T, Yoshimura N, Ohi H, Tanaka S, Andoh A, Ohmiya N, Saigusa K, Yamamoto T, Morohoshi Y, Ichikawa H, Matsuoka K, Hisamatsu T, Watanabe K, Mizuno S, Suda W, Hattori M, Fukuda S, Hirayama A, Abe T, Watanabe M, Hibi T, Suzuki Y, Kanai T; INDIGO Study Group.
Efficacy of Indigo naturalis in a Multicenter Randomized Controlled Trial of Patients with Ulcerative Colitis.
Gastroenterology (2017) in press. doi:10.1053/j.gastro.2017.11.024.

5. Otsubo T, Yamada K, Hagiwara T, Oshima K, Iida K, Nishikata K, Toyoda T, Igari T, Nohara K, Yamashita S, Hattori M, Dohi T, Kawamura YI.
DNA hypermethyation and silencing of PITX1 correlated with advanced stage and poor postoperative prognosis of esophageal squamous cell carcinoma.
Oncotarget. (2017) 8:84434-84448. doi:10.18632/oncotarget.21375.